اساساً ساز و کارهای موجود در سیستم پیمانکاری و سوء استفاده های فراوانی که در این چهارچوب صورت می گیرد باعث بروز مشکلات و معضلات عدیده ای در حق نیروی انسانی و کارکنان فعال در حوزه های خدماتی شده است که به حداقل رسیدن امنیت شغلی، اجحاف نسبت به نیروی کار، پذیرش هر گونه زور و بی عدالتی در سیستم های اداری، تبعیض، ناعدالتی، عدم پرداخت مزایای شغلی، ایجاد سیستم های چندگانه حقوق و دستمزد برای نیروهای رسمی، پیمانی، قراردادی، کار معین و شرکتی، عدم کارآمدی سیستم اداری و در نهایت نارضایتی افراد شاغل از مهمترین آن هاست.
