شکی نیست که قرآن را نمی‌توان به عنوان یک کتاب علوم طبیعی معرفی کرد و اصولا چنین انتظاری را نباید داشته باشیم که تمام اسرار علوم طبیعی، فرمولهای ریاضی، جزئیات علم تشریح و مثلا نام و نشانی تمام داروها ، بیماری‌ها و راه پیشگیری یا درمان آنها با همه خصوصیات و جزئیات آنها در قرآن باشد، چرا که قرآن برای این هدف نازل نشده، قرآن یک دایره المعارف نیست، بلکه یک کتاب تربیت و هدایت است، هدایت نوع بشر به سوی یک زندگی به تمام معنی انسانی و سعادتمندانه با همه ویژگی‌هایش و این هدف را تامین کرده است.
از این رو اگر چیزی از اسرار علوم و حقایق جهان آفرینش در قرآن است، حتما برای یک هدف تربیتی و اخلاقی یا تعلیم درس توحید و خداشناسی آمده نه به عنوان عرضه کردن علوم طبیعی و مانند آن به سبک دایره‌المعارف قرآن مجید در بحثهای تربیتی و توحیدی خود پرده از روی یک سلسله حقایق علمی که بر مردم آن عصر مستور بوده بردارد و پیروان خود را در کشف این حقایق از طرق علمی کمک کند و هم ارتباط خود را با جهانی مافوق جهان ماده و محیط محدود افکار بشری اثباب کند.
چند نمونه از آیاتی که جزو معجزات علمی قرآن محسوب می‌گردد و از روی حقایقی که در آن روز از نظر دانشمندان مخفی بوده و قرنها بعد از نزول کشف شده است به آن اشاره می‌شود.
قرآن و حرکت زمین، قرآن و زوجیت در جهان گیاهان، قرآن و جاذبه عمومی، قرآن و اسرار آفرینش کوهها، قرآن و پیدایش جهان، قر آن و زندگی در کرات دیگر از جمله موارد تطبیق آیات قرآنی بر اکتشافات علمی است.
