محمدرضا حکیمی در آثار خود، بسیاری از کتابها و موضوعات مطالعاتی را نام میبرد و به صورت مستقیم یا غیرمستقیم، مطالعه آنها را پیشنهاد میدهند. به ویژه اینکه مطالعه برخی از آنها را نه تنها برای طلبه و دانشجو، بلکه برای همگان ضروری و حیاتی میدانند.
با اندک تورق و تأملی در آثار استاد، کتب و موضوعات پیشنهادی استاد را میتوان به دو دسته تقسیم کرد: یک دسته معارف الهی و اسلامی اصیل است و دسته دوم، کتابهایی است که درباره این معارف یا زندگانی بزرگان دین نوشته شده است.