ایجاد و گسترش فضاهای معنوی و اسلامی، رشد فضایل اخلاقی و تقویت نشاط در دانشگاه، حمایت و هدایت فکری تشکل های دانشجویی، رشد بینش سیاسی در محیط دانشگاه، توسعه و تعمیق آگاهی ها، تبیین احکام و ارزش های اسلامی و تقویت پیوند حوزه و دانشگاه از جمله مهم ترین اهداف ایجاد دفاتر نهادهای رهبری در دانشگاه هاست.شورای عالی انقلاب فرهنگی راه اندازی دفاتر نهاد رهبری در دانشگاه ها را در سال 72 تصویب کرد.کمک به توانمند سازی نیروهای با استعداد دانشگاهی، ارتقای سطح معرفت دینی و قرآنی، توسعه فرهنگ اقامه نماز جماعت، بزرگداشت شعائر دینی و ایجاد انسجام و همدلی میان دانشجویان و تشکل های دانشجویی از مهم ترین وظایف تعریف شده برای دفاتر نهاد مقام معظم رهبری در دانشگاه هاست.
یکی از مراکز مهم فرهنگی و دینی که در دانشگاه های سراسر کشور و از جمله در 4 دانشگاه خراسان شمالی فعالیت می کند، دفتر نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری است.
فعالیت این دفتر از سال 72 با رویکرد ارتقای معرفت و بینش دینی دانشجویان در دانشگاه های کشور آغاز شد. پی گیری مطالبات مقام معظم رهبری از جامعه دانشگاهی، برگزاری برنامه های دینی و مذهبی به خصوص اعزام دانشجویان به حج عمره و همچنین ایجاد زمینه لازم برای ازدواج دانشجویی از جمله فعالیت های نهاد رهبری طی سال های اخیر بوده است.برگزاری کرسی های آزاد اندیشی طبق فرمایش مقام معظم رهبری در دانشگاه ها، یکی از برنامه های دفاتر نهاد رهبری دانشگاه های استان است که از ابتدای سال تحصیلی تاکنون در چند دانشگاه به این موضوع پرداخته شده است