انچه گفته شد در رابطه با اتوكلاو اتوماتیك بود اما دراتوكلاو دستی اگرچه اصول كار همانند اتوكلاو اتوماتیك است اما تفاوتهایی بدین صورت دارند كه برای ورود بخار به محفظه ، شیر ورودی به صورت دستی باز و بسته میشود و تخلیه بخار نیز بصورت دستی انجام میگیردو باز و بسته كردن در نیز به صورت دستی انجام میشود.
زمانی از این اتوكلاو استفاده میشود كه اتوكلاو اتوماتیك در دسترس نباشد یا دارای مشكل فنی باشد.