با وجود بسیاری روایات متعدد در کتب تاریخی و نیز نقل قول های بزرگان دینی در مورد مقام با عظمت حضرت رقیه سلام الله علیها و اثبات وجود آن حضرت در کربلا و حوادث بعد از آن و مهمتر از همه رابطه نَسبی ایشان بعنوان دختر حضرت اباعبدالله الحسین(علیه السلام) متأسفانه بعضاً شبهاتی در مورد آن حضرت بیان شده است.
شبهه: جایی دیده نشده حضرت رقیه (سلام الله علیها)دختر امام حسین(علیه السلام)باشد!!
پاسخ: در مورد منابعی که حضرت رقیه را دختر سه ساله امام حسین معرفی کرده اند اگر بخواهیم به اختصار فقط نام ببریم فهرستی بلند بالا خواهد شد ولی برای نمونه برخی از انها را ذکر میکنیم:
1- اولین منبعی که در حال حاضر در اختیار ما قرار دارد و به این قضیه اشاره کرده مقتل ابی مخنف می باشد وی که در سال 157 ق وفات کرد از یاران امام باقر و امام صادق علیهما السلام بوده است.
2 - الملهوف علی قتلی الطفوف تالیف سید بن طاووس از منابعی است که به حضرت رقیه اشاره کرده است.
3- از دیگر منابع در این زمینه کتاب کامل بهایی تالیف عماد الدین طبری است.
به جز منابعی که نام حضرت رقیه در آن ها برده شده و برای ما سند است برخی مویدات نیز وجود دارد که وجود ایشان را از جهت علمی تثبیت میکند مثلا اینکه علمای بزرگی که بسیار اهل دقت و احتیاط در برخی امور بوده اند به قصد زیارت حضرت رقیه به حرم ایشان مشرف شده اند. افرادی همچون شیخ بهایی ، محدث قمی ، مرحوم ایت الله میرزا جواد تبریزی و بسیاری دیگر از علما که در این نوشتار نظرات بزرگان و مراجع عظام تقلید را درباره این وجود نورانی بیان مینمائیم.